Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Praf2Q9JIG8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Praf2Q9JIG8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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