Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pus3Q9JI38 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms