Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms