Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn12Q9ET43 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms