Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm9sf3Q9ET30 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm9sf3Q9ET30 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm9sf3Q9ET30 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm9sf3Q9ET30 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm9sf3Q9ET30 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm9sf3Q9ET30 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms