Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Pgpep1Q9ESW8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Pgpep1Q9ESW8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pgpep1Q9ESW8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms