Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tubb3Q9ERD7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tubb3Q9ERD7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms