Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn12Q9ER56 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms