Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clstn1Q9EPL2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clstn1Q9EPL2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms