Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne8Q9DC53 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne8Q9DC53 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms