Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CrotQ9DC50 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms