Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pop5Q9DB28 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pop5Q9DB28 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pop5Q9DB28 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pop5Q9DB28 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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