Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc89Q9DA73 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc89Q9DA73 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms