Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Tmem239Q9DA47 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Tmem239Q9DA47 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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