Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Samd8Q9DA37 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms