Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Pdzd9Q9D9M4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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Pdzd9Q9D9M4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdzd9Q9D9M4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Pdzd9Q9D9M4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Pdzd9Q9D9M4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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Pdzd9Q9D9M4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdzd9Q9D9M4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
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Pdzd9Q9D9M4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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