Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bpifa3Q9D9J8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bpifa3Q9D9J8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms