Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmco5aQ9D9D5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms