Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnot8Q9D8X5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot8Q9D8X5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms