Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc91Q9D8L5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms