Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cyp2c55Q9D816 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms