Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capn9Q9D805 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms