Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d4aQ9D7V1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d4aQ9D7V1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms