Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn22Q9D7U6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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