Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cldn23Q9D7D7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn23Q9D7D7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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