Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nop56Q9D6Z1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Nop56Q9D6Z1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Nop56Q9D6Z1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Nop56Q9D6Z1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Nop56Q9D6Z1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Nop56Q9D6Z1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nop56Q9D6Z1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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