Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pfn4Q9D6I3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms