Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rtl8cQ9D6I0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms