Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm5Q9D6G9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm5Q9D6G9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm5Q9D6G9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm5Q9D6G9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm5Q9D6G9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm5Q9D6G9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm5Q9D6G9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm5Q9D6G9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm5Q9D6G9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm5Q9D6G9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm5Q9D6G9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cmtm5Q9D6G9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cmtm5Q9D6G9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms