Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rab11fip1Q9D620 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rab11fip1Q9D620 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rab11fip1Q9D620 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Rab11fip1Q9D620 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rab11fip1Q9D620 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rab11fip1Q9D620 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rab11fip1Q9D620 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rab11fip1Q9D620 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rab11fip1Q9D620 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip1Q9D620 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rab11fip1Q9D620 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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