Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3a3Q9D554 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sf3a3Q9D554 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms