Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PrameQ9D4Z5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PrameQ9D4Z5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms