Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tubgcp4Q9D4F8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms