Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q9D1F3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9D1F3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms