Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syf2Q9D198 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syf2Q9D198 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms