Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Susd3Q9D176 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms