Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem53Q9D0Z3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Tmem53Q9D0Z3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Tmem53Q9D0Z3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Tmem53Q9D0Z3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Tmem53Q9D0Z3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmem53Q9D0Z3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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