Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ddx56Q9D0R4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ddx56Q9D0R4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ddx56Q9D0R4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ddx56Q9D0R4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx56Q9D0R4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ddx56Q9D0R4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ddx56Q9D0R4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Ddx56Q9D0R4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ddx56Q9D0R4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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