Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gtf2e1Q9D0D5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms