Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spc24Q9D083 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms