Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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