Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Shisa9Q9CZN4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisa9Q9CZN4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms