Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx7Q9CY18 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms