Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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