Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Xrcc3Q9CXE6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Xrcc3Q9CXE6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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