Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sugt1Q9CX34 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms