Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf1Q9CWX2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf1Q9CWX2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms