Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms