Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma8Q9CWH6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms