Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
NubplQ9CWD8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms